单细胞多组学 一胞三测 WTA+VDJ 全长V(D)J

BD Rhapsody™ 单细胞全转录组 + TCR/BCR 联合检测
真正单细胞多组学 — 一胞三测

基于 BD Rhapsody™ 微孔阵列 + 磁珠捕获平台,在同一个细胞中同步完成全转录组测序(WTA)、T 细胞受体(TCR)全长 VDJ 测序和 B 细胞受体(BCR)全长 VDJ 测序。磁珠同时带有 3' 和 5' 两端接头——3' 端捕获全转录组 mRNA,5' 端捕获 TCR/BCR 可变区 mRNA。三种文库来自同一管 cDNA、同一个细胞,共享 Cell Barcode,实现细胞水平的一一对应。

BD Rhapsody™ Single Cell
Cell Barcode + UMI
微孔+磁珠双捕获
核心优势

为什么选择 BD Rhapsody™ 平台

微孔物理分隔技术带来低多细胞率、高捕获效率和稳定的数据质量

真正单细胞多组学

转录组+TCR+BCR来自同一个细胞,数据精准关联

一胞三测

一次实验获得表达谱+受体序列双重维度信息

低多细胞率

微孔物理分隔,多细胞率 < 1%

全长VDJ覆盖

不限于CDR3,覆盖完整可变区

高灵敏度

WTA中位基因数3,000~8,000个/细胞(PBMC);链配对率 > 70%

灵活扩展

可叠加AbSeq蛋白组、Sample Tag混样等模块

技术流程

标准实验流程,稳定可靠的数据产出

从样本制备到生信分析,全流程标准化质控,确保实验结果的稳定性与可重复性

1

单细胞悬液制备与质检

细胞悬液制备、活性检测

2

单细胞捕获

微孔+磁珠,3'+5'双端捕获

3

细胞裂解与mRNA杂交

mRNA与磁珠双端探针结合

4

逆转录与cDNA扩增

合成cDNA并扩增

5

三种文库分别构建

WTA/TCR/BCR三种文库构建

6

多组学联合分析

转录组+免疫组库联合生信分析

联合分析特色

转录组+免疫组库联合分析,深入挖掘免疫特征

三组数据来自同一个细胞,共享Cell Barcode,实现细胞水平的精确关联与深度分析

克隆型UMAP空间映射

将TCR/BCR克隆型信息映射到转录组UMAP上,直观展示克隆扩增细胞的分布与细胞类型特征

克隆扩增细胞转录特征

解析克隆扩增T/B细胞的基因表达特征,关联细胞状态与功能,揭示克隆扩增的分子机制

抗原特异细胞多组学挖掘

联合抗原特异性预测算法,从转录组和免疫组库两个维度鉴定抗原特异T/B细胞亚群

克隆型-细胞状态关联分析

系统分析克隆型与细胞状态/功能的关联,深入理解免疫细胞的命运决定与功能分化

样本要求

样本准备指南

规范的样本制备是高质量单细胞数据的基础,请在送样前参考以下要求

项目 要求
样本类型 PBMC、新鲜组织解离细胞、培养细胞
细胞总量 ≥ 1×10⁵ 个活细胞(建议2×10⁵ ~ 1×10⁶)
细胞活率 ≥ 80%(低于70%需提前沟通)
细胞大小 ≤ 30 μm
保存运输 新鲜样本4℃运输24h内到达;或冻存细胞干冰运输
生信分析内容

全面的生信分析方案

从标准分析到高级分析,提供多维度的单细胞数据挖掘与可视化服务

标准分析

WTA全转录组分析:质控、表达定量、降维聚类、细胞类型注释
WTA:GO/KEGG富集、GSEA分析、细胞通讯分析(可选)
TCR分析:VDJ组装、克隆型分析、链配对分析
TCR分析:克隆多样性分析、V/J基因取用
BCR分析:VDJ组装、克隆型分析、抗体亚型分析
BCR分析:体细胞超突变分析、克隆谱系树构建

高级分析(可选)

TCR/BCR克隆型在转录组UMAP上的空间映射
克隆扩增细胞的转录特征解析
抗原特异性T/B细胞亚群的多组学特征联合挖掘
克隆型与细胞状态/功能的关联分析
应用场景

广泛的研究应用方向

适用于生命科学研究的多个领域,助力高水平科研成果产出

肿瘤免疫研究

TIL克隆扩增与转录状态关联、免疫治疗应答机制

抗体开发与发现

抗原特异B细胞序列挖掘、抗体亲和力成熟过程追踪

自身免疫病研究

自身反应性T/B细胞克隆鉴定与功能特征分析

感染与疫苗研究

抗原特异T/B细胞追踪、疫苗免疫组库评估

移植与免疫监测

免疫重建过程监测、GVHD相关克隆鉴定

推荐测序量

WTA ≥ 50,000 reads/cell;TCR ≥ 5,000 reads/cell;BCR ≥ 5,000 reads/cell

高通量测序平台,PE150

获取方案
常见问题

FAQ 常见问题解答

关于产品和实验的常见问题,更多问题请联系技术支持

Q WTA + VDJ 联合检测和分别做两个样本有什么区别?
A

联合检测的三组数据来自同一个细胞,共享 Cell Barcode,可以精确关联每个细胞的基因表达和受体序列;分开检测则是不同细胞群体,无法建立一一对应关系。

Q 联合检测会影响各组数据的质量吗?
A

不会。三种文库从同一 cDNA 中分别扩增,各有独立的引物体系,互不干扰。BD 平台的双端捕获设计确保了转录组和 VDJ 的数据质量。

Q 可以只做 WTA + TCR,不做 BCR 吗?
A

可以。根据研究需求灵活选择,支持 WTA+TCR、WTA+BCR、或 WTA+TCR+BCR 三种组合模式。

05 单细胞WTA加VDJ联合分析有什么优势?
单细胞WTA加VDJ联合分析可以同时获取每个细胞的全转录组表达谱和免疫组库序列,优势包括:1)将T/B细胞的克隆型与基因表达特征关联,揭示细胞功能状态;2)追踪免疫细胞的克隆扩增与分化轨迹;3)发现新的免疫细胞亚群及其特征基因;4)为免疫治疗、疫苗开发等研究提供更全面的数据支撑。
06 BD WTA加VDJ的样本要求是什么?
BD WTA加VDJ要求细胞活性不低于80%,细胞总量建议不少于2×10^6个(因需同时做转录组和VDJ),细胞浓度在500至1000 cells/μL之间。样本建议为PBMC、淋巴结、脾细胞等富含免疫细胞的样本。送样前建议与技术团队确认样本准备方案和推荐细胞投入量。
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