CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是一种研究蛋白质与DNA互作的高效方法。该方法通过将高活性的Tn5转座酶与Protein A融合形成pA-Tn5转座复合物，在抗体的引导下靶向切割目的蛋白附近的DNA序列，并同时在序列两端加上测序接头，经PCR扩增后形成可直接用于高通量测序的文库。
结合生物信息学分析，找到转录因子下游调控的靶基因，为进一步阐明生物学机制提供依据。
与传统ChIP-Seq相比，CUT&Tag无需甲醛交联与免疫共沉淀，通过抗体和Protein G/A介导使融合的Tn5酶在靶位点直接切割并加接头，实验流程更短、信噪比更高。
细胞沉淀制备
靶蛋白结合
信号放大
转座复合物招募
加接头同步完成
片段化DNA纯化
文库扩增富集
浓度与片段分布
高通量测序
相比传统ChIP-Seq技术，CUT&Tag在起始量、信噪比、操作便捷性等方面表现突出
最低仅需60个细胞即可完成实验，特别适合稀有样本和微量细胞的研究需求。
无需交联与超声打断操作，规避了其所引起的抗原决定簇遮盖和样本损失问题，提高了信噪比。
无需免疫共沉淀，切割与加接头一步完成，实验流程更短，操作更便捷。
酶切反应更均匀稳定，实验结果重复性好，数据质量更可靠。
适用于组蛋白修饰、转录因子、RNA聚合酶II等多种靶标的蛋白质-DNA互作研究。
JZ040201
CUT&Tag 分子互作研究服务，可根据研究需求定制实验方案。
从原始数据质控到功能富集分析，提供完整的CUT&Tag数据分析解决方案
FastQC质量统计、碱基分布分析
Bowtie2/BWA比对、比对率统计
基因区域富集分析、信号分布可视化
FRiP值计算、文库复杂度分析
信号强度分布、基因组元件占比
MACS2峰检测、峰统计与注释
基因组元件分布、邻近基因注释
结合序列特征分析、转录因子富集
组间差异峰检测、火山图/MA图展示
GO/KEGG富集分析、通路可视化
支持细胞样本和动物组织样本，不同样本类型有不同的送样要求和运输条件
| 样本类型 | 起始量要求 | 样本质量要求 | 运输条件 |
|---|---|---|---|
| 细胞样本 | 细胞数 > 60个 | 上海周边地区可以送贴壁或悬浮细胞，细胞活率需达90%以上 | 常温运输 |
| 动物组织（小量） | 质量 > 10mg | 组织需要新鲜，无血管无结缔组织等杂质 | -80℃冻存，干冰运输 |
| 动物组织（大量） | 质量 > 500mg | 锡纸包裹，组织完整，液氮速冻 | 液氮冻存，干冰运输 |
从项目启动到报告交付，全流程透明可控，周期视项目而定
定制实验方案
样本质检入库
CUT&Tag建库测序
数据分析交付
项目结题与售后
基础/高级/定制三档方案，满足不同研究深度需求
CUT&Tag 与传统 ChIP-Seq 的主要区别在于：（1）无需甲醛交联，避免了交联引起的抗原决定簇遮盖问题；（2）无需超声打断，减少了样本损失和背景噪音；（3）无需免疫共沉淀，操作更简便，实验流程更短；（4）起始量更低，最低仅需60个细胞即可完成实验；（5）Tn5酶在靶位点直接切割并加接头，一步完成建库，信噪比更高。
CUT&Tag 技术可从基因组范围内检测多种蛋白质结合的DNA区域，包括：组蛋白修饰（如H3K4me3、H3K27ac、H3K27me3等）、RNA聚合酶II、以及各种转录因子。适用于临床和科研的表观遗传学研究，结合生物信息学分析可找到转录因子下游调控的靶基因，为阐明生物学机制提供依据。
CUT&Tag 支持多种样本类型：细胞样本需大于60个，上海周边地区可送贴壁或悬浮细胞，常温运输；动物组织小量样本需大于10mg，组织需要新鲜且无杂质，-80℃冻存，干冰运输；动物组织大量样本需大于500mg，锡纸包裹后液氮冻存，干冰运输。具体送样细节请联系我们的技术支持。
CUT&Tag 的生信分析内容包括：原始测序数据质量评估、比对参考基因组、gene body富集热图、ChIP质量评估、累计分布曲线、Peak calling（MACS2叫峰）、Peak注释、Motif分析、差异peak鉴定与注释、差异peak功能富集分析等。我们提供基础分析方案和高级分析方案，也可以根据您的研究需求定制个性化分析内容。
专业表观遗传学技术团队为您提供从实验设计到生信分析的全流程服务支持，低起始量高信噪比，欢迎联系我们获取定制化解决方案。
