环状RNA（circular RNA, circRNA）是一类通过反向剪接形成的共价闭合环状非编码RNA分子，对核酸外切酶RNase R具有天然抗性，比线性RNA更稳定、半衰期更长。circRNA功能多样，包括作为miRNA海绵（ceRNA机制）、结合RNA结合蛋白、参与转录调控、少数可翻译为多肽等，已成为疾病分子标志物、肿瘤诊断预后和调控机制研究的热点。
本服务采用去rRNA + RNase R富集策略，有效富集环状RNA分子，结合高通量测序和专业生信分析，实现circRNA的全面鉴定与定量。
从总RNA提取到生信分析，全流程标准化管控
环状RNA由前体mRNA通过反向剪接（back-splicing）形成，其3'端和5'端共价连接形成闭合环状结构，因此对核酸外切酶RNase R具有天然抗性。
利用RNase R降解线性RNA，特异性富集环状RNA，提高检测灵敏度
find_circ与CIRI2双算法并行检测，取并集提高circRNA鉴定的灵敏度和准确性
dUTP方案保留链方向信息，准确区分正义链与反义链来源的circRNA
样本RNA提取
纯度完整性检测
核糖体RNA去除
保留其他RNA
降解线性RNA
富集circRNA
dUTP方案
保留链方向
文库浓度检测
片段大小分析
PE 150测序
高质量数据产出
双算法鉴定
功能深度挖掘
针对不同研究目的，提供标准circRNA、全转录组整合、高深度circRNA等多种方案
去rRNA + RNase R + 链特异性建库，适合circRNA常规鉴定与表达谱分析。
去rRNA + 链特异性建库，同时分析mRNA / lncRNA / circRNA，适合全转录组整合研究。
去rRNA + RNase R + 链特异性 + 加深数据，适合低丰度circRNA鉴定与新circRNA挖掘。
| 方案类型 | 建库方式 | 数据量 | 测序模式 | 质量标准 |
|---|---|---|---|---|
| 标准circRNA | 去rRNA + RNase R + 链特异性 | 10-12 G clean data | PE 150 | Q30 ≥ 85% |
| 全转录组整合 | 去rRNA + 链特异性 | 12-15 G clean data | PE 150 | |
| 高深度circRNA | 去rRNA + RNase R + 链特异性 + 加深 | 15-20 G clean data | PE 150 |
从circRNA鉴定定量到功能深度挖掘，提供系统化生物信息分析
原始数据质控、接头与低质量序列过滤、clean data统计
find_circ + CIRI2双算法并行鉴定，circBase等数据库比对注释
BSR / RPM / TPM多种定量方式，样本间表达量比较
样本相关性分析、PCA主成分分析、样本重复性评估
差异circRNA筛选、火山图与热图展示、表达模式聚类
差异circRNA宿主基因GO功能与KEGG通路富集分析
circRNA长度分布、染色体分布、外显子数目统计、类型分类
circBase / circAtlas / circBank 等多数据库联合注释
基于TargetScan/miRanda预测circRNA结合的miRNA及结合位点
构建circRNA-miRNA-mRNA内源竞争RNA调控网络
基于数据库预测circRNA上RNA结合蛋白的结合位点
ORF预测、IRES分析、m⁶A修饰位点预测、翻译潜能评估
同一基因位点不同环化方式鉴定与差异分析
跨物种circRNA序列保守性与剪接位点保守性分析
ROC曲线分析、LASSO回归模型构建、诊断标志物筛选
circRNA染色体分布、表达量、差异情况Circos图展示
circRNA表达与临床表型、生存预后等指标的关联分析
* 具体分析内容可根据研究需求灵活调整，详询技术顾问
富集 + 鉴定 + 注释 + 分析，全方位保障项目质量
find_circ + CIRI2 并行检测，取并集提高circRNA鉴定的灵敏度和准确性，减少单一算法的假阴性。
利用RNase R特异性降解线性RNA，有效富集环状RNA分子，显著提高circRNA检测深度和灵敏度。
dUTP方案保留链方向信息，准确区分正义链与反义链来源的circRNA，提高注释准确性。
结合circBase、circAtlas、circBank等多个专业数据库，注释全面，信息丰富。
提供miRNA海绵预测、ceRNA网络构建、RBP结合位点预测、编码潜能预测等多维度功能分析。
数十物种、上千例样本分析经验，专业生信团队提供稳定可靠的分析结果。
多种样本类型均可送检，专业技术人员全程指导样本准备
| 样本类型 | 推荐起始量 | 最低起始量 | 保存与运输 | 质量要求 |
|---|---|---|---|---|
| 总RNA | ≥ 5 μg | ≥ 3 μg 浓度 ≥ 100 ng/μL |
-80℃ 保存，干冰运输 | RIN ≥ 7（动物）/ ≥ 6.5（植物）；OD260/280 = 1.8-2.1 |
| 组织样本 | ≥ 50 mg | ≥ 30 mg | -80℃ 保存，干冰运输 | 新鲜组织离体后快速液氮冻存，避免反复冻融；FFPE样本需 ≥ 5张切片（10μm） |
| 细胞样本 | ≥ 5×10⁶ 个 | ≥ 2×10⁶ 个 | -80℃ 保存，干冰运输 | 收集细胞后PBS洗涤，加入Trizol或直接冻存细胞沉淀；避免细胞降解 |
| 全血 | ≥ 2 mL（抗凝） | — | 4℃ 保存，冰袋运输（24h内） | 使用EDTA或枸橼酸钠抗凝管采集，避免溶血；采集后尽快处理 |
| 血清/血浆 | ≥ 5 mL / ≥ 2 mL | — | -80℃ 保存，干冰运输 | 避免溶血和血小板污染；血浆建议使用EDTA抗凝，分离后立即冻存 |
| FFPE样本 | ≥ 5张切片（10μm） | — | 常温保存，常温运输 | 切片厚度10μm，肿瘤组织含量 ≥ 30%；建议使用1年以内的FFPE样本 |
* 样本量不足或特殊样本请咨询技术顾问，送样前建议先进行样本质量评估
基础 / 高级 / 定制方案，满足不同研究深度需求
适合circRNA初步筛选与表达谱分析
包含深度功能挖掘与调控网络分析
根据研究目标定制个性化分析方案
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