中科普瑞 / 上海鲸舟基因 · 2024年8月官方认证
DNBelab C4 高通量单细胞RNA文库制备系统基于Drop-seq液滴捕获原理,将带有Cell Barcode的凝胶微珠(大磁珠)、带有oligo测序标签的凝胶微珠(小磁珠)和单个细胞包裹在同一个油包水液滴中。细胞裂解后mRNA被大磁珠oligo-dT捕获,与小磁珠测序接头结合,在液滴中进行逆转录反应,破乳回收后构建cDNA文库和Oligo文库,最后上机测序。
平台搭载DNBSEQ-T7超高通量测序系统,支持3' RNA单细胞转录组测序,一次检测上万细胞基因表达谱,实现高灵敏度、高稳定性、高性价比的单细胞研究解决方案。
绘制组织器官水平的全细胞类型表达图谱
精细分群,鉴定低比例稀有细胞类型
肿瘤微环境、异质性、耐药机制研究
追踪细胞分化轨迹与发育调控网络
免疫细胞分型、免疫应答机制解析
疾病分子分型、诊断与预后标志物筛选
基于微流控技术,将单细胞、大磁珠(Cell Barcode)和小磁珠(测序标签)共同包裹于油包水液滴中,在液滴内完成细胞裂解、mRNA捕获和逆转录。
从样本质检到测序交付,完整标准化的单细胞测序实验流程。
活性>80%,浓度700~1200 cells/μL为佳
液滴包裹单细胞与磁珠
逆转录+破油纯化+扩增质检
片段化+Index PCR+质检
DNBSEQ-T7,PE150,推荐50K reads/cell
从捕获效率到数据分析,全流程保障单细胞测序数据质量。
99:1混合细胞中可检出1.3%稀有细胞比例,灵敏度出众
兼容活细胞悬液+液氮速冻样本(细胞核水平研究),不限物种
搭配DNBSEQ测序系统,单个细胞数据不混淆,准确性高
Dr. Tom单细胞全交互式数据挖掘系统,深度数据挖掘
支持流式分选服务,从组织到数据的全流程解决方案
从基础定量到高级分析,提供完整的单细胞数据解读方案。
质控、比对、定量→表达谱矩阵
降维、聚类、细胞类型判定
热图、小提琴图、特征图
GO、KEGG、GSEA富集分析
重构细胞分化轨迹,解析发育进程中的基因动态表达调控。
基于配体-受体对的细胞间相互作用预测,揭示微环境细胞通讯网络。
TCR/BCR V(D)J重组分析,克隆型多样性评估,免疫组库特征解析。
中文最全酶解方案查询平台,覆盖蛋白组学、代谢组学、宏基因组等多组学研究中的各类酶解实验方案。支持智能搜索、多方案参数对比、一键导出,助力科研人员快速找到合适实验条件。
| 样本类型 | 送样量 | 说明 |
|---|---|---|
| 组织样本 | 100-200mg | 黄豆粒大小,湿重 |
| 细胞样本 | >105 cells | 活细胞悬液 |
| 全血样本 | 4mL | EDTA采血管 |
包含细胞悬液质检、GEM生成、文库构建、测序及标准分析
基础服务全部内容 + 高级分析(拟时序/细胞通讯/富集分析等)+ Dr.Tom系统
单细胞转录组 + 蛋白组/空间转录组/ATAC等多组学联合 + 完整方案设计
DNBelab C4平台基于Drop-seq液滴捕获原理,是国产自主可控的高通量单细胞平台,搭载DNBSEQ-T7超高通量测序系统。其主要优势包括:高性价比,显著降低单细胞研究门槛;稀有细胞捕获效率高,99:1混合细胞中可检出1.3%稀有细胞;兼容活细胞悬液和液氮速冻样本;搭配DNBSEQ测序系统数据保真度高;并配备Dr. Tom交互式分析系统,一站式服务流程。
标准通量为5,000-10,000个单细胞/样本,实际捕获细胞数会因样本类型和质量有所差异。推荐测序深度为50K reads/cell,可根据研究目的调整:细胞图谱类研究建议更高深度,细胞分群类研究50K reads/cell通常可满足需求。具体方案可咨询技术支持进行评估。
可以。DNBelab C4平台兼容液氮速冻样本,可通过提取细胞核进行单核RNA测序(snRNA-seq),适用于难以制备活细胞悬液的样本,如临床冻存组织、珍贵样本等。液氮速冻肺组织样本可获得约12,822个细胞核,每细胞核检测基因数中位数可达1,000以上。
DNBelab C4平台不限物种,只要有参考基因组或转录组序列即可进行分析。目前已成功应用于人、小鼠、大鼠、斑马鱼、拟南芥等多种动植物物种。对于非模式物种,需要根据可用的基因组/转录组注释信息进行评估。
标准交付内容包括:原始测序数据(fastq格式)、基因表达矩阵、质控报告、标准分析结果(降维聚类、差异分析、细胞类型注释、富集分析等)及可视化图表。高级服务额外交付高级分析结果(拟时序、细胞通讯等)。所有服务均提供Dr. Tom交互式数据分析系统账号,可自主进行深度数据挖掘。
细胞活性低于80%的样本,我们会先进行质检评估。可以考虑使用死细胞去除试剂盒进行富集,或改用单核测序方案。建议提前与技术人员沟通样本情况,我们会根据具体样本类型和状态给出优化的实验方案建议。
DNBelab C4平台支持1~4张载片独立运行,每张载片可处理多个样本通道,具体数量视实验方案而定。平台灵活度高,可根据项目样本量安排实验批次,无需凑样等待。如有大批量样本,可咨询技术支持制定合适的批量实验方案。