基于高通量测序技术,对特定环境样品中微生物总DNA进行检测,经过序列组装和基因注释,完成全基因组分析。研究内容涵盖微生物多样性、群落结构、物种分类、进化关系、基因功能及微生物与宿主环境之间的相互关系。
相比扩增子测序,宏基因组可深入菌株水平,功能注释更为全面
| 对比维度 | 宏基因组测序 | 扩增子测序 (16S/18S/ITS) |
|---|---|---|
| 分辨率 | 菌株水平,可发现近缘菌株差异 | 属/种水平,受引物限制 |
| 检测范围 | 全部微生物类群,无引物偏倚 | 仅引物靶向类群,存在偏倚 |
| 功能分析 | 直接基因功能注释,多数据库支持 | 基于物种组成预测,准确度有限 |
| 耐药/毒力基因 | 可直接检测耐药基因与毒力因子 | 无法直接检测 |
| 数据量需求 | 较高,通常 6-10 Gb/样本 | 较低,数万条序列即可 |
| 分析复杂度 | 高,需组装与注释流程 | 相对简单,OTU/ASV 聚类 |
可深入到菌株水平进行分析,发现近缘菌株间的基因组与功能差异,精准解析菌群结构。
覆盖 KEGG、eggNOG、CAZy 等多数据库,物种组成与基因功能同步注释,全面解析菌群功能潜力。
ARDB、VFDB 专业数据库支持,精准识别耐药基因与毒力因子,助力致病菌机制研究。
不受引物偏倚影响,覆盖全部微生物类群,包括难培养与未知物种,检测范围更为广泛。
可与宏转录组、代谢组、蛋白组联动分析,从基因到代谢多层次揭示微生物功能活性。
支持宏基因组关联研究(MWAS),适用于大规模队列样本的菌群与表型关联分析。
从DNA抽提到生物信息分析,全流程标准化管控
微生物DNA提取
浓度与完整性检测
片段化与接头连接
文库质检与定量
多平台
PE150测序策略
组装与基因预测
物种功能注释
物种组成 + 功能注释 + 高级分析,全方位挖掘宏基因组数据价值
物种注释 + 多样性分析
多数据库功能注释
深度挖掘,助力高水平研究
* 具体分析内容可根据研究需求灵活调整,详询技术顾问
平台 + 技术 + 团队 + 质控,全方位保障服务质量
多平台可选,满足不同项目通量与成本需求,PE150 测序策略。
DNA质检 + 文库质检 + 测序质控三重把关,QC样本全程监控,数据质量可靠。
整合 NCBI NR、KEGG、eggNOG、CAZy、ARDB、VFDB 等多数据库,注释信息全面。
经验丰富的生信分析团队,精通宏基因组组装与注释流程,可提供定制化分析服务。
专属项目经理跟进,定期汇报项目进度,确保项目按时交付,沟通高效顺畅。
从实验设计到数据分析,专业技术人员全程指导,助力研究成果产出与论文发表。
多种样本类型兼容,专业技术人员全程指导样本准备
| 样本类型 | 推荐起始量 | 保存条件 | 注意事项 |
|---|---|---|---|
| 粪便 | ≥ 500 mg | -80℃ 保存,干冰运输 | 样本收集后立即冻存,避免室温放置时间过长,建议分装保存 |
| 肠道内容物 | ≥ 500 mg | -80℃ 保存,干冰运输 | 解剖后立即收集,注意去除黏膜组织,液氮速冻后-80℃保存 |
| 唾液 | ≥ 2 mL | -80℃ 保存,干冰运输 | 收集前禁食禁水30min,使用专用唾液采集管,避免食物残留污染 |
| 皮肤拭子 | 拭子 2-3 根 | -80℃ 保存,干冰运输 | 采样前避免清洁皮肤,使用无菌拭子擦拭采样部位,保存液中-80℃冻存 |
| 土壤 | ≥ 5 g | -80℃ 保存,干冰运输 | 采集后去除石块植物根系等杂质,过筛后分装,避免反复冻融 |
| 水体 | 滤膜 / 沉淀菌体 | -80℃ 保存,干冰运输 | 使用 0.22μm 滤膜过滤收集菌体,或离心收集沉淀,立即-80℃冻存 |
| 污泥 | ≥ 2 g | -80℃ 保存,干冰运输 | 采集后分装保存,避免混合不均匀,注意样本代表性 |
| 食品 | 视类型而定 | -80℃ 保存,干冰运输 | 根据食品类型确定取样量,注意无菌操作,避免外源微生物污染 |
* 其他类型样本请咨询技术顾问,送样前建议先进行样本质量评估
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