全转录组测序(Whole Transcriptome Sequencing, WTS)是对细胞内全部RNA分子进行高通量测序分析的技术,涵盖mRNA、lncRNA、circRNA和miRNA四大类RNA分子。通过去rRNA + 链特异性建库,保留编码与非编码RNA,一次测序同时获得多维度转录组信息;结合ceRNA调控网络分析,系统解析非编码RNA的调控机制。
基因表达调控网络
非编码RNA功能机制
ceRNA调控网络
疾病分子标志物筛选
发育分化机制
肿瘤进展机制
链特异性建库保留转录方向信息,全面解析编码与非编码RNA
一次建库同时获得mRNA、lncRNA、circRNA三类信息,miRNA需单独小RNA文库。
保留转录本方向信息,反义转录本鉴定更准确,转录组注释精度更高。
既可基因/转录本水平定量,又可发现新转录本、可变剪接和融合基因。
可构建ceRNA调控网络,系统解析非编码RNA的调控机制与功能。
根据研究目的与分析方向,推荐相应的数据量与建库方式
| 分析方向 | 推荐数据量 | 读长 | 建库方式 |
|---|---|---|---|
| 标准全转录组(mRNA+lncRNA) | 10-12 G | PE 150 | 去rRNA + 链特异性 |
| 含circRNA全转录组 | 12-15 G | PE 150 | 去rRNA + RNase R + 链特异性 |
| 高深度定量+新转录本 | 15-20 G | PE 150 | 去rRNA + 链特异性 |
| 小RNA测序(单独建库) | 10-20M reads | SE 50 | 小RNA专用建库 |
* 项目周期视项目而定,具体请咨询技术支持。
覆盖基础分析、mRNA深度分析、lncRNA分析、circRNA分析、ceRNA网络及小RNA分析六大模块
rRNA残留率稳定低于5%,多物种兼容,人/大小鼠/其他物种均适用。
保留转录链方向信息,反义lncRNA鉴定更准确,转录组注释精度更高。
CNCI / CPC / Pfam 三重编码潜能预测,假阳性低,lncRNA鉴定更可靠。
find_circ + CIRI2 双软件交叉验证,circRNA鉴定结果更准确可信。
从RNA提取到全套信息分析,全流程闭环管理,无需多平台对接。
数千例项目经验,覆盖临床组织、细胞系、外泌体、FFPE等多种样本类型。
标准 + 高级 + 定制三级分析体系,可根据研究需求灵活组合分析内容。
总RNA、细胞、组织、FFPE等多种样本类型均支持,严格质控保障实验质量
涵盖基础质控、表达定量、差异分析与功能富集,满足常规研究需求。
在标准分析基础上增加lncRNA/circRNA深度分析、ceRNA调控网络等。
根据研究课题深度定制,包括高级可视化、整合分析、专项算法开发等。
专业技术团队为您提供从实验设计到多维度生信分析的全流程服务支持,欢迎联系我们获取定制化全转录组研究方案。